Massimo Pinto

La prima Heatmap...

28 Apr 2009

…non si scorda mai. Risolto - grazie alla rete ed ai volontari - il problema a cui facevo riferimento ieri, prosegue l’avventura nella trascrittomica. Ecco qui la mia primissima Heatmap[1], di una prima parte delle misure di microarray prodotte grazie alla collaborazione con Budapest, relativi all’esperimento in cui prendo parte qui a Roma, il Silenzio Cosmico. La mappa contiene 7 colonne (7 campioni sperimentali, di 24) e 50 righe rappresentanti i primi 50 geni (i cui nomi sono riportati sulla destra ed annotati come A_23…) più regolati nei trattamenti a cui sono stati sottoposti i campioni sperimentali. I geni il cui livello di espressione scende (verde, la maggior parte) oppure sale (rosso) vengono raggruppati in clusters evidenziati dai dendrogrammi, a sinistra ed in alto rispetto al grafico principale. Proseguo lo studio, per cominciare a dare un senso a tutto ciò.

[1] Heatmaps

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